W 1993 roku Stowarzyszenie utworzyło własne szkoły:
 Szkołę Podstawową nr 86 SKiE i Liceum Ogólnokształcące nr 50 SKiE. W 1998 r wraz z Ministerstwem Edukacji Narodowej powołano do życia pierwsze w Polsce Gimnazjum, obecnie Gimnazjum nr 5 SKiE. Równolegle zostało utworzone Centrum Kultury Okopowa, promujące sztukę ambitną, w tym najwartościowszą sztukę współczesną. Z Centrum Kultury ściśle współpracują Jerzy Kornowicz - kompozytor i animator życia muzycznego oraz Beata Chwedorzewska - aktorka, realizatorka wielu spektakli szkolnych. Z Centrum współpracowali i współpracują tak wybitni artyści jak: Maciej Wojtyszko, Antoni Libera, Jan Peszek, Beata Chwedorzewska, Dariusz Kunowski, Łucja Prus, Antonina Krzysztoń, Ewa Bem, Olena Leonenko, Tomasz Stańko, Andrzej Jagodziński, Wojciech Karolak, Włodzimierz Pawlik, Krzysztof Knittel, Krzysztof Bąkowski, Jacek Kasprzyk, Beatriz Bianco, Jerzy Kornowicz, Tadeusz Wielecki i wielu innych. W 1998r. Stowarzyszenie wydzierżawiło gospodarstwo z budynkami w Ciopanie k/Stanisławowa, kupując je następnie w 2000 roku . Odtąd Ciopan stał się wspaniałą bazą terenową dla uczniów i nauczycieli naszych szkół. FILOZOFIA DZIAŁANIA SZKÓŁ Program pedagogiczny szkół opiera się na oryginalnej teorii podmiotowości, z której wyprowadzone są własne metody nauczania i wychowania, sposób zorganizowania szkoły i działania Centrum Kultury Okopowa. Jest on opisany w licznych artykułach naukowych i popularnych oraz w dwóch osobnych książkach. System pedagogiczny szkoły jest od lat przedmiotem wykładów uniwersyteckich oraz kursów, szkoleń i studiów podyplomowych dla studentów, nauczycieli, dyrektorów szkół i doradców metodycznych. Z takich założeń wyprowadzamy pięć podstawowych atutów naszych szkół: Indywidualne podejście do ucznia. Każdy kto ma jakiekolwiek zainteresowania i pasje może być pewien, że będą one w szkole mile widziane. Zamiast zaszkodzić, pomogą mu w funkcjonowaniu szkolnym. Ciągłość nauki. Uczeń rozpoczynający naukę w dowolnej klasie, ma szanse pozostać u nas do matury. Trzy szkoły mieszczą się w jednym budynku. W żadnym roku nauki nie zmienią mu się wszyscy nauczyciele jednocześnie. Bezpieczeństwo. W niewielkich szkołach, gdzie wszyscy się znają, a kadra jest specjalnie kształcona, nie ma anonimowości uczniów. Nie znamy dzięki temu większości patologii szkolnych, jak przemoc, narkotyki itp. Pomagają w tym nasze programy profilaktyczne realizowane poprzez bogate i atrakcyjne działania sportowe, naukowe, artystyczne i turystyczne. Rozwój kulturalny. Szkoła stosuje specjalną metodę stymulacji rozwoju intelektualnego oraz tzw. dyspozycji celowych, poprzez program podmiotowej edukacji kulturalnej. Nasi uczniowie mają stały kontakt z najwybitniejszymi twórcami kultury z kraju i zagranicy. Uczestniczą aktywnie w licznych formach życia artystycznego i intelektualnego oraz stale są odbiorcami wartościowego repertuaru kulturalnego Centrum Kultury Okopowa. Kadra. Specjalne sposoby działania wymagają ludzi o specjalnych cechach. Udaje nam się gromadzić takich ludzi. Oni tworzą klimat szkoły. Rozległe kompetencje umożliwiają im prowadzenie rozlicznych zajęć dodatkowych. Część nauczycieli uczy jednocześnie w Szkole Podstawowej i Gimnazjum, część w Gimnazjum i Liceum, co dla uczniów przechodzących do szkoły wyższego szczebla jest ogromnym komfortem. W Gimnazjum i Liceum obowiązują indywidualne ścieżki programowe w pięciu specjalnościach: humanistyczna, ścisła, przyrodnicza, artystyczna, językowa.